国家重点实验室面向前沿科学、基础科学、工程科学等，开展基础研究、应用基础研究等，推动学科发展，促进技术进步，发挥原始创新能力的引领带动作用。目前，我院主共有国家重点实验室82个（包括其他部门主管、我院研究所建设或参与建设的国家重点实验室4个），我院国重数量约占全国总数的1/3：其中，数理、地学领域超过1/2，化学、生物、信息领域超过全国1/3，材料、医学领域我院国家重点实验室较少，工程领域很少。 
　　序号
　　实验室名称
　　实验室代码
　　学科
　　依托单位
　　实验室主任
　　学术委员会主任
　　1
　　催化基础国家重点实验室
　　1984DA173081
　　化学
　　中国科学院大连化学物理研究所
　　申文杰
　　李灿
　　2
　　分子反应动力学国家重点实验室
　　1987DA173131
　　化学
　　中国科学院大连化学物理研究所
　　张东辉
　　郑兰荪
　　3
　　生命有机化学国家重点实验室
　　1989DA173051
　　化学
　　中国科学院上海有机化学研究所
　　俞飚
　　林国强
　　4
　　煤转化国家重点实验室
　　1991DA173641
　　化学
　　中国科学院山西煤炭化学研究所
　　樊卫斌
　　赵东元
　　5
　　羰基合成与选择氧化国家重点实验室
　　1991DA173651
　　化学
　　中国科学院兰州化学物理研究所
　　夏春谷
　　李灿
　　6
　　结构化学国家重点实验室
　　1992DA173011
　　化学
　　中国科学院福建物质结构研究所
　　郭国聪
　　姚建年
　　7
　　高分子物理与化学国家重点实验室
　　2000DA173031
　　化学
　　中国科学院长春应用化学研究所，中国科学院化学研究所
　　杨小牛
　　周其凤
　　8
　　金属有机化学国家重点实验室
　　2000DA173041
　　化学
　　中国科学院上海有机化学研究所
　　游书力
　　麻生明
　　9
　　电分析化学国家重点实验室
　　2001DA173031
　　化学
　　中国科学院长春应用化学研究所
　　逯乐慧
　　万立骏
　　10
　　多相复杂系统国家重点实验室
　　2006DA173101
　　化学
　　中国科学院过程工程研究所
　　葛蔚
　　程津培
　　11
　　稀土资源利用国家重点实验室
　　2007DA173041
　　化学
　　中国科学院长春应用化学研究所
　　薛冬峰
　　洪茂椿
　　12
　　波谱与原子分子物理国家重点实验室
　　1986DA173082
　　数理
　　武汉物理与数学研究所
　　邓风
　　杨国桢
　　13
　　声场声信息国家重点实验室
　　1987DA173062
　　数理
　　中国科学院声学研究所
　　王海斌
　　张仁和
　　14
　　半导体超晶格国家重点实验室
　　1988DA173072
　　数理
　　中科院半导体研究所
　　王开友
　　高鸿钧
　　15
　　科学与工程计算国家重点实验室
　　1991DA173732
　　数理
　　中国科学院数学与系统科学研究院
　　张林波
　　袁亚湘
　　16
　　非线性力学国家重点实验室
　　1999DA173022
　　数理
　　中国科学院力学研究所
　　魏宇杰
　　方岱宁
　　17
　　强场激光物理国家重点实验室
　　2004DA173092
　　数理
　　中国科学院上海光学精密机械研究所
　　冷雨欣
　　徐至展
　　18
　　核探测与核电子学国家重点实验室
　　2011DA173412
　　数理
　　中国科学院高能物理研究所、中国科学技术大学
　　安琪
　　陈和生
　　19
　　高温气体动力学国家重点实验室
　　2011DA173422
　　数理
　　中国科学院力学研究所
　　张新宇
　　姜宗林
　　20
　　资源与环境信息系统国家重点实验室
　　1985DA173073
　　地学
　　中国科学院地理科学与资源研究所
　　苏奋振
　　杨元喜
　　21
　　冻土工程国家重点实验室
　　1989DA173047
　　地学
　　中国科学院寒区旱区环境与工程研究所
　　吴青柏
　　傅伯杰
　　22
　　有机地球化学国家重点实验室
　　1990DA173043
　　地学
　　中国科学院广州地球化学研究所
　　张干
　　陶澍
　　23
　　大气科学和地球流体力学数值模拟国家重点实验室
　　1990DA173053
　　地学
　　大气物理研究所
　　肖子牛
　　穆穆
　　24
　　环境模拟与污染控制国家重点实验室
　　1991DA105433
　　地学
　　中国科学院 生态环境研究中心
　　王东升
　　曲久辉
　　25
　　黄土高原土壤侵蚀与旱地农业国家重点实验室
　　1991DA173763
　　地学
　　中国科学院教育部水土保持与生态环境研究中心
　　刘宝元
　　秦大河
　　26
　　大气边界层物理和大气化学国家重点实验室
　　1991DA173803
　　地学
　　中国科学院大气物理研究所
　　王自发
　　刘文清
　　27
　　环境地球化学国家重点实验室
　　1991DA173813
　　地学
　　中国科学院地球化学研究所
　　冯新斌
　　刘丛强
　　28
　　黄土与第四纪地质国家重点实验室
　　1993DA173013
　　地学
　　中国科学院地球环境研究所
　　金章东
　　周卫健
　　29
　　现代古生物学和地层学国家重点实验室
　　2001DA173023
　　地学
　　中国科学院南京地质古生物研究所
　　袁训来
　　周忠和
　　30
　　土壤与农业可持续发展国家重点实验室
　　2003DA173013
　　地学
　　中国科学院南京土壤研究所
　　张甘霖
　　周健民
　　31
　　遥感科学国家重点实验室
　　2003DA173033
　　地学
　　中国科学院遥感与数字地球研究所 北京师范大学
　　施建成
　　徐冠华
　　32
　　环境化学与生态毒理学国家重点实验室
　　2004DA173013
　　地学
　　中国科学院生态环境研究中心
　　江桂斌
　　陈宜瑜
　　33
　　岩石圈演化国家重点实验室
　　2004DA173233
　　地学
　　中国科学院地质与地球物理研究所
　　吴福元
　　郑永飞
　　34
　　空间天气学国家重点实验室
　　2006DA173013
　　地学
　　中国科学院空间科学与应用研究中心
　　王赤
　　万卫星
　　35
　　矿床地球化学国家重点实验室
　　2006DA173133
　　地学
　　中国科学院地球化学研究所
　　胡瑞忠
　　李曙光
　　36
　　城市与区域生态国家重点实验室
　　2006DA173173
　　地学
　　中国科学院生态环境研究中心
　　陈利顶
　　傅伯杰
　　37
　　冰冻圈科学国家重点实验室
　　2007DA173103
　　地学
　　中国科学院寒区旱区环境与工程研究所
　　康世昌
　　秦大河
　　38
　　湖泊与环境国家重点实验室
　　2007DA173213
　　地学
　　中国科学院南京地理与湖泊研究所
　　沈吉
　　秦大河
　　39
　　植被与环境变化国家重点实验室
　　2007DA173233
　　地学
　　中国科学院植物研究所
　　张文浩
　　方精云
　　40
　　同位素地球化学国家重点实验室
　　2011DA173163
　　地学
　　中国科学院广州地球化学研究所
　　徐义刚
　　郑永飞
　　41
　　大地测量与地球动力学国家重点实验室 
　　2011DA173173
　　地学
　　中国科学院测量与地球物理研究所
　　倪四道
　　陈俊勇
　　42
　　荒漠与绿洲生态国家重点实验室 
　　2011DA173183
　　地学
　　中国科学院新疆生态与地理研究所
　　陈亚宁
　　秦大河
　　43
　　热带海洋环境国家重点实验室 
　　2011DA173203
　　地学
　　中国科学院南海海洋研究所
　　王春在
　　苏纪兰
　　44
　　分子生物学国家重点实验室
　　1984DA173094
　　生命
　　中科院上海生命科学研究院
　　周金秋
　　施蕴渝
　　45
　　植物分子遗传国家重点实验室
　　1986DA173074
　　生命
　　中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所
　　龚继明
　　许智宏
　　46
　　淡水生态与生物技术国家重点实验室
　　1987DA173074
　　生命
　　中国科学院水生生物研究所
　　殷战
　　朱作言
　　47
　　生物大分子国家重点实验室
　　1988DA173084
　　生命
　　中国科学院生物物理研究所
　　徐涛
　　施蕴渝
　　48
　　膜生物学国家重点实验室
　　1988DA173104
　　生命
　　中国科学院动物研究所
　　赵勇
　　武维华
　　49
　　植物细胞与染色体工程国家重点实验室
　　1991DA173744
　　生命
　　中国科学院遗传与发育生物学研究所
　　傅向东
　　武维华
　　50
　　农业虫害鼠害综合治理研究国家重点实验室
　　1991DA173754
　　生命
　　中国科学院动物研究所
　　戈峰
　　康乐
　　51
　　微生物资源前期开发国家重点实验室
　　1991DA173774
　　生命
　　中国科学院微生物研究所
　　向华
　　邓子新
　　52
　　植物基因组学国家重点实验室
　　2003DA173024
　　生命
　　中国科学院遗传与发育生物学研究所，中国科学院微生物研究所
　　左建儒
　　方荣祥
　　53
　　病毒学国家重点实验室
　　2004DA105204
　　生命
　　武汉大学、中国科学院武汉病毒研究所
　　蓝柯
　　陈焕春
　　54
　　系统与进化植物学国家重点实验室
　　2004DA173024
　　生命
　　中国科学院植物研究所
　　孔宏智
　　陈晓亚
　　55
　　遗传资源与进化国家重点实验室
　　2007DA173114
　　生命
　　中科院昆明动物研究所
　　施鹏
　　朱作言
　　56
　　神经科学国家重点实验室
　　2007DA173244
　　生命
　　中国科学院上海生命科学研究院
　　周嘉伟
　　蒲慕明
　　57
　　分子发育生物学国家重点实验室
　　2011DA173474
　　生命
　　中国科学院遗传与发育生物学研究所
　　杨维才
　　孟安明
　　58
　　真菌学国家重点实验室 
　　2011DA173484
　　生命
　　中国科学院微生物研究所
　　蔡磊
　　庄文颖
　　59
　　干细胞与生殖生物学国家重点实验室
　　1991DA110044
　　医学
　　中国科学院动物研究所
　　王红梅
　　裴刚
　　60
　　生化工程国家重点实验室
　　1991DA173788
　　医学
　　中国科学院过程工程研究所
　　马光辉
　　杨胜利
　　61
　　新药研究国家重点实验室
　　1991DA173798
　　医学
　　中国科学院上海药物研究所
　　李佳
　　裴钢
　　62
　　植物化学与西部植物资源持续利用国家重点实验室
　　2001DA173058
　　医学
　　中国科学院昆明植物研究所
　　陈纪军
　　孙汉董
　　63
　　细胞生物学国家重点实验室 
　　2011DA173458
　　医学
　　中国科学院上海生命科学研究院生化与细胞所
　　李劲松
　　王红阳
　　64
　　脑与认知科学国家重点实验室
　　2004DA173138
　　医学
　　中国科学院生物物理研究所
　　何生
　　陈霖
　　65
　　模式识别国家重点实验室
　　1984DA173065
　　信息
　　中科院自动化研究所
　　刘成林
　　谭铁牛
　　66
　　应用光学国家重点实验室
　　1986DA173065
　　信息
　　中国科学院长春光学精密机械与物理研究所
　　曹健林
　　周寿桓
　　67
　　集成光电子学国家重点联合实验室
　　1987DA105095
　　信息
　　吉林大学、中国科学院半导体研究所
　　黄永箴
　　孙洪波
　　68
　　传感技术联合国家重点实验室
　　1987DA173085
　　信息
　　中国科学院上海微系统与信息技术研究所、中国科学院电子学研究所
　　程建功
　　吴一戎
　　69
　　信息安全国家重点实验室
　　1989DA173065
　　信息
　　中国科学院信息工程研究所
　　孟丹
　　黄民强
　　70
　　红外物理国家重点实验室
　　1990DA173065
　　信息
　　中国科学院上海技术物理研究所
　　陈效双
　　褚君浩
　　71
　　微细加工光学技术国家重点实验室
　　1991DA173715
　　信息
　　中国科学院光电技术研究所
　　罗先刚
　　周炳琨
　　72
　　瞬态光学与光子技术国家重点实验室
　　1991DA173725
　　信息
　　西安光学精密机械研究所
　　赵卫
　　张杰
　　73
　　计算机科学国家重点实验室
　　2004DA173035
　　信息
　　中国科学院软件研究所
　　沈一栋
　　陈国良
　　74
　　机器人学国家重点实验室
　　2007DA173035
　　信息
　　中国科学院沈阳自动化研究所
　　于海斌
　　熊有伦
　　75
　　计算机体系结构国家重点实验室
　　2011DA173295
　　信息
　　中国科学院计算技术研究所
　　孙凝晖
　　李国杰
　　76
　　复杂系统管理与控制国家重点实验室
　　2011DA173315
　　信息
　　中国科学院自动化研究所
　　王飞跃
　　吴宏鑫
　　77
　　发光学及应用国家重点实验室 
　　2011DA173395
　　信息
　　中国科学院长春光学精密机械与物理研究所
　　申德振
　　薛其坤
　　78
　　高性能陶瓷和超微结构国家重点实验室
　　1991DA173696
　　材料
　　中国科学院上海硅酸盐研究所
　　陈立东
　　江东亮
　　79
　　信息功能材料国家重点实验室
　　1991DA173706
　　材料
　　中科院上海微系统与信息技术研究所
　　谢晓明
　　王曦
　　80
　　固体润滑国家重点实验室
　　1999DA173016
　　材料
　　中科院兰州化学物理研究所
　　周峰
　　薛群基
　　81
　　火灾科学国家重点实验室
　　1991DA173827
　　工程
　　中国科学技术大学
　　张和平
　　范维澄
　　82
　　岩土力学与工程国家重点实验室
　　2007DA173257
　　工程
　　中国科学院武汉岩土力学研究所
　　薛强
　　谢和平